2025年夏航季，南京机场与51家航司合作通达119个航点，高峰日航班量达750架次。

国内客运方面，国内通航城市84个，环比2024年冬航季计划新增临汾、敦煌、衡阳、十堰、库车、茅台、韶关、湘西等8个航点。深圳、广州、成都等商务快线每天执行20班以上，为商务旅客提供便利；换季后，泉州、成都和兰州等热门城市持续加密，新增2班以上，出行选择更丰富。

南京至东京、大阪、名古屋、首尔、济州、新加坡、曼谷、廊曼、普吉、美娜多、芽庄、河内、胡志明、悉尼、墨尔本、吉隆坡、斗湖、香港、澳门、台北、台中、高雄等国际及港澳台客运航线正常执行。3月13日起，南京直飞米兰国际客运航班开启夏航季模式，每周两班；4月19日起，南京直飞神户国际客运航线精彩开航。